MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 59665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017448	TTG	2	6	58	63	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
2	NC_017448	T	6	6	124	129	0 %	100 %	0 %	0 %	385789061
3	NC_017448	TGA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789061
4	NC_017448	TTG	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
5	NC_017448	TTG	2	6	281	286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
6	NC_017448	AAG	2	6	370	375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
7	NC_017448	AGC	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789061
8	NC_017448	TTG	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789061
9	NC_017448	TGC	2	6	573	578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789061
10	NC_017448	AGA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
11	NC_017448	GCC	2	6	593	598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789061
12	NC_017448	T	6	6	633	638	0 %	100 %	0 %	0 %	385789061
13	NC_017448	CAA	2	6	672	677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789061
14	NC_017448	GGT	2	6	873	878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789061
15	NC_017448	AAG	2	6	934	939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
16	NC_017448	CCT	2	6	956	961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789061
17	NC_017448	TGA	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789061
18	NC_017448	AAG	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
19	NC_017448	GAA	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789061
20	NC_017448	GGC	2	6	1207	1212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789061
21	NC_017448	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789061
22	NC_017448	CGC	2	6	1413	1418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789061
23	NC_017448	A	6	6	2599	2604	100 %	0 %	0 %	0 %	385789062
24	NC_017448	A	6	6	2677	2682	100 %	0 %	0 %	0 %	385789062
25	NC_017448	TCA	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789062
26	NC_017448	TCT	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789062
27	NC_017448	GAT	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789062
28	NC_017448	GAAGT	2	10	2734	2743	40 %	20 %	40 %	0 %	385789062
29	NC_017448	CCT	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789062
30	NC_017448	AAG	2	6	2767	2772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789062
31	NC_017448	GAC	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789062
32	NC_017448	AAG	2	6	2797	2802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789062
33	NC_017448	ATA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789062
34	NC_017448	CTC	2	6	2853	2858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789062
35	NC_017448	TTC	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789062
36	NC_017448	GTCTTC	2	12	2910	2921	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385789062
37	NC_017448	GTT	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
38	NC_017448	AGCA	2	8	3022	3029	50 %	0 %	25 %	25 %	385789062
39	NC_017448	TTG	2	6	3035	3040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
40	NC_017448	TCG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789062
41	NC_017448	CGT	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789062
42	NC_017448	ACG	2	6	3355	3360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789062
43	NC_017448	ACGTTC	2	12	3364	3375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385789062
44	NC_017448	GGC	2	6	3433	3438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789062
45	NC_017448	GTT	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
46	NC_017448	CGGAA	2	10	3522	3531	40 %	0 %	40 %	20 %	385789062
47	NC_017448	ACG	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789062
48	NC_017448	CGAATA	2	12	3594	3605	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385789062
49	NC_017448	TCG	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789062
50	NC_017448	TTG	2	6	3698	3703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789062
51	NC_017448	CAA	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789062
52	NC_017448	TGA	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789062
53	NC_017448	CAA	2	6	3864	3869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789062
54	NC_017448	AGT	3	9	3947	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789062
55	NC_017448	A	6	6	4031	4036	100 %	0 %	0 %	0 %	385789063
56	NC_017448	T	7	7	4060	4066	0 %	100 %	0 %	0 %	385789063
57	NC_017448	TGAAA	2	10	4088	4097	60 %	20 %	20 %	0 %	385789063
58	NC_017448	TTC	2	6	4293	4298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789063
59	NC_017448	TG	3	6	4300	4305	0 %	50 %	50 %	0 %	385789063
60	NC_017448	CGC	2	6	4324	4329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789063
61	NC_017448	GGTC	2	8	4373	4380	0 %	25 %	50 %	25 %	385789063
62	NC_017448	ACG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789063
63	NC_017448	ATT	2	6	4893	4898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789063
64	NC_017448	TGA	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789063
65	NC_017448	TGT	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789063
66	NC_017448	CAA	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789063
67	NC_017448	TGC	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789063
68	NC_017448	CGA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789063
69	NC_017448	TCG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789063
70	NC_017448	CCG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789063
71	NC_017448	TC	3	6	5507	5512	0 %	50 %	0 %	50 %	385789063
72	NC_017448	CGG	2	6	5531	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789063
73	NC_017448	A	6	6	5770	5775	100 %	0 %	0 %	0 %	385789064
74	NC_017448	GTC	2	6	5778	5783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
75	NC_017448	CGT	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
76	NC_017448	GGTC	2	8	5903	5910	0 %	25 %	50 %	25 %	385789064
77	NC_017448	GTC	2	6	5937	5942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
78	NC_017448	ACG	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789064
79	NC_017448	GGT	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789064
80	NC_017448	TAT	2	6	6107	6112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789064
81	NC_017448	GAA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789064
82	NC_017448	CTG	3	9	6215	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789064
83	NC_017448	GGT	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789064
84	NC_017448	ACG	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789064
85	NC_017448	GCG	2	6	6259	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789064
86	NC_017448	AAG	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789064
87	NC_017448	CGAATG	2	12	6275	6286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385789064
88	NC_017448	CAA	2	6	6299	6304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789064
89	NC_017448	CGG	2	6	6323	6328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789064
90	NC_017448	GTAA	2	8	6361	6368	50 %	25 %	25 %	0 %	385789064
91	NC_017448	TCG	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789065
92	NC_017448	CCT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789065
93	NC_017448	GAA	2	6	6647	6652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
94	NC_017448	GAA	2	6	6707	6712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
95	NC_017448	CTC	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789065
96	NC_017448	GCTA	2	8	6947	6954	25 %	25 %	25 %	25 %	385789065
97	NC_017448	GTT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789065
98	NC_017448	CGA	2	6	7065	7070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789065
99	NC_017448	GAA	2	6	7159	7164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
100	NC_017448	CT	3	6	7234	7239	0 %	50 %	0 %	50 %	385789065
101	NC_017448	GCT	2	6	7337	7342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789065
102	NC_017448	GGCG	2	8	7378	7385	0 %	0 %	75 %	25 %	385789065
103	NC_017448	CAAG	2	8	7494	7501	50 %	0 %	25 %	25 %	385789065
104	NC_017448	GAA	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789065
105	NC_017448	CAA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789065
106	NC_017448	TTG	2	6	7653	7658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789065
107	NC_017448	GTT	2	6	7661	7666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789065
108	NC_017448	ACGCT	2	10	7677	7686	20 %	20 %	20 %	40 %	385789065
109	NC_017448	ATA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789065
110	NC_017448	GGCA	2	8	7741	7748	25 %	0 %	50 %	25 %	385789065
111	NC_017448	TTA	2	6	7780	7785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789065
112	NC_017448	TGA	2	6	7861	7866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789065
113	NC_017448	GGC	2	6	7873	7878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789065
114	NC_017448	TGG	2	6	7939	7944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789065
115	NC_017448	A	6	6	8001	8006	100 %	0 %	0 %	0 %	385789066
116	NC_017448	GGC	2	6	8030	8035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789066
117	NC_017448	AGA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789066
118	NC_017448	TTG	2	6	8100	8105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789066
119	NC_017448	A	6	6	8158	8163	100 %	0 %	0 %	0 %	385789066
120	NC_017448	TGA	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789066
121	NC_017448	GAA	2	6	8241	8246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789066
122	NC_017448	GAC	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789066
123	NC_017448	GTGG	2	8	8364	8371	0 %	25 %	75 %	0 %	385789066
124	NC_017448	GC	3	6	8423	8428	0 %	0 %	50 %	50 %	385789066
125	NC_017448	TTGA	2	8	8436	8443	25 %	50 %	25 %	0 %	385789066
126	NC_017448	TGAT	2	8	8458	8465	25 %	50 %	25 %	0 %	385789066
127	NC_017448	CGAAGA	2	12	8678	8689	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385789066
128	NC_017448	GCC	2	6	8709	8714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789066
129	NC_017448	TGA	2	6	8893	8898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789066
130	NC_017448	AAG	2	6	8916	8921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789066
131	NC_017448	GAA	2	6	9063	9068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789066
132	NC_017448	CGA	2	6	9089	9094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789066
133	NC_017448	TC	3	6	9222	9227	0 %	50 %	0 %	50 %	385789067
134	NC_017448	CCGA	2	8	9313	9320	25 %	0 %	25 %	50 %	385789067
135	NC_017448	T	6	6	9328	9333	0 %	100 %	0 %	0 %	385789067
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137	NC_017448	TCA	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789067
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241	NC_017448	AATAA	2	10	15738	15747	80 %	20 %	0 %	0 %	385789072
242	NC_017448	T	9	9	15758	15766	0 %	100 %	0 %	0 %	385789072
243	NC_017448	GCC	2	6	15855	15860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789072
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245	NC_017448	CTATC	2	10	15914	15923	20 %	40 %	0 %	40 %	385789072
246	NC_017448	GAT	2	6	15977	15982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789072
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248	NC_017448	TTCG	2	8	16059	16066	0 %	50 %	25 %	25 %	385789072
249	NC_017448	CT	3	6	16072	16077	0 %	50 %	0 %	50 %	385789072
250	NC_017448	CAG	3	9	16206	16214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789072
251	NC_017448	TC	3	6	16263	16268	0 %	50 %	0 %	50 %	385789072
252	NC_017448	CAA	2	6	16295	16300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789072
253	NC_017448	CTCG	2	8	16358	16365	0 %	25 %	25 %	50 %	385789072
254	NC_017448	GAA	2	6	16376	16381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789072
255	NC_017448	TC	3	6	16440	16445	0 %	50 %	0 %	50 %	385789072
256	NC_017448	CGC	2	6	16467	16472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385789072
257	NC_017448	TGT	2	6	16520	16525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789072
258	NC_017448	CTT	2	6	16586	16591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789072
259	NC_017448	TGC	2	6	16604	16609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789072
260	NC_017448	TGA	2	6	16652	16657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789072
261	NC_017448	TAC	2	6	16689	16694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789072
262	NC_017448	ACG	3	9	16716	16724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789072
263	NC_017448	TTC	2	6	16745	16750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789072
264	NC_017448	GGC	2	6	16776	16781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789072
265	NC_017448	GAA	2	6	16830	16835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789072
266	NC_017448	GCT	2	6	16836	16841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789072
267	NC_017448	CAT	2	6	16898	16903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789072
268	NC_017448	GAA	2	6	16922	16927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789072
269	NC_017448	TCC	2	6	16966	16971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789072
270	NC_017448	CTT	2	6	16984	16989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789072
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273	NC_017448	CGAA	2	8	17173	17180	50 %	0 %	25 %	25 %	385789072
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281	NC_017448	AAG	2	6	17580	17585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789072
282	NC_017448	GAA	2	6	17598	17603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789072
283	NC_017448	GAA	2	6	17607	17612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789072
284	NC_017448	TGA	2	6	17653	17658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789072
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286	NC_017448	TCT	2	6	18258	18263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789073
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292	NC_017448	AAC	2	6	18601	18606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789073
293	NC_017448	TCT	2	6	18665	18670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789073
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296	NC_017448	TGG	2	6	18948	18953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789073
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